Sarkawi B. Husein dilahirkan pada 29 Juni di Tolitoli (Sulawesi Tengah). Menyelesaikan pendidikan sarjana di Jurusan Sejarah Fakultas Sastra Universitas Hasanuddin Makassar, tahun 1994 dengan skripsi berjudul “Gerakan Buruh di Makassar 1942-1955” dan pendidikan magister di Jurusan Ilmu-ilmu Humaniora, Program Pascasarjana UGM Yogyakarta tahun 1998 dengan tesis tentang “Perkembangan Pendidikan Kolonial di Makassar 1876-1942”. Pada tahun 2016, menyelesaikan pendidikan S3 di Universitas Gadjah Mada dengan disertasi yang berjudul: Mengubah dan Merusak Lingkungan, Mengundang Air Bah: Banjir di Kota Surabaya pada Paruh Kedua Abad ke-20.